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iTRAQ试剂包括3个部分:报告基团(report group)、平衡基团(balance group)和肽反应基团(amine-specific reactive group)。报告基团相对分子质量为113-121Da(无120),因此iTRAQ 试剂可同时标记8 组样品。平衡基团相对分子质量为192-184Da(无185),使得八种iTRAQ试剂分子量均为305Da,保证标记的同一肽段m/z 相同。 肽反应基团将iTRAQ试剂与肽段上赖氨酸及N端氨基酸残基相连,在其上报告基团通过平衡基团与反应基团相连,形成等量异位标签。