近年来，长链RNA治疗药物和疫苗（如CRISPR sgRNA、mRNA）发展迅速，其长度可达数百至数千个核苷酸。由于仅靠完整质量分析难以**评估其特性，需采用酶切策略确认序列并检测修饰。
近年来，以长链RNA为基础的治疗药物（CRISPR sgRNA、mRNA）和疫苗发展迅速，这类RNA的核苷酸长度从100个到数千个不等，与长度相近的蛋白质类似，仅通过完整质量分析无法**了解其特性。需要借助基于酶切的策略来确认序列，并评估靶向修饰和非预期修饰。
**的MAP Sequence 2.0 App能够通过LC-MS分析寡核苷酸序列图谱，确认长链RNA分子的完整性、线性序列和修饰情况。用户通过序列特异性RNase酶对RNA进行酶切，生成可预测的酶切寡核苷酸产物后，可通过LC-MSE对这些酶切寡核苷酸进行分析，构建寡核苷酸图谱。这一过程类似于酶切蛋白质后的肽图分析。而MAP Sequence信息学工具会利用质量和碎片信息，将图谱中的峰与酶切片段进行匹配。
图1. 使用MAP Sequence 2.0版比较sgRNA经三种酶（RapiZyme Cusativin、RapiZyme MC1和RNase T1）酶解后获得的序列覆盖率。合并序列覆盖率表明，通过工作流程中概述的复合酶解方法，可以实现沃特世sgRNA的完整序列表征。
MAP Sequence 2.0 App具有以下优势功能：
能够原生处理来自 BioAccord、Xevo G3 QTof和Xevo MRT系统的数据，可以根据自身对可用性、灵敏度和质量准确度的需求选择合适的平台。
具备整合多次图谱分析结果，和灵活支持多种酶切策略的能力，为实现高可信度的高序列覆盖率提供了较大可能。
提供多种用于数据审查和报告的数据及结果可视化工具，能够清晰、简洁地呈现图谱中单个酶切寡核苷酸的结果，以及整个分子图谱的汇总结果。
搭载在waters_connect质谱软件平台，作为一款合规软件，waters_connect可部署于产品及工艺研发阶段的RNA表征工作，也可用于构建经验证的常规分析方法，在受监管的生产与产品放行流程中监控这些关键属性。
