BioPhase™ 8800 CE-LIF有效分离长度相近mRNA，支持双价/多价mRNA质量分析

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mRNA-LNP 从单价走向双价、多价后，分析目标也从“是否有 mRNA、是否完整”进一步扩展为：不同 mRNA 之间能否分开、各自是否完整、LNP装载后的各价mRNA的比例是否准确。对于长度接近的 mRNA，常规分离方法难以同时满足分辨率和定量可靠性要求。

实现结果

分离不同价态mRNA，避免相近长度组分共迁移或峰重叠。
在破乳条件下评估mRNA完整性和片段/降解信息。
对双价或多价制剂中的各价mRNA占比进行可重复的定量。
在工艺开发、处方开发和质量研究中建立可转移的CE分析平台。

应用方案：

BioPhase™ 8800 + RNA 9000 P&I kit

本研究在BioPhase™ 8800系统上，将两条相近长度的mRNA混合以模拟破乳处理的双价mRNA-LNP：CD19 CAR mRNA和FLuc mRNA，采用RNA 9000 Purity & Integrity kit进行分析。检测方式包括CE-LIF和CE-UV，并比较了毛细管温度在30 °C与35 °C、进样方式为压力进样与电动进样等条件下的效果。

平台	SCIEX BioPhase™ 8800，配置UV/LIF检测器
试剂盒	RNA 9000 Purity & Integrity kit
检测方式	CE-LIF：488 nm激发 / 520 nm发射；同时比较CE-UV 254 nm
分析对象	CD19 CAR mRNA与FLuc mRNA；大小约1.8 kb与1.9 kb，长度差约7%
模拟样品	空LNP + Triton X-100破乳体系，模拟单价与双价mRNA-LNP样品

结果1：相近长度mRNA实现基线分离

在模拟的双价mRNA-LNP样品中，CD19 CAR和FLuc两条mRNA的理论占比为1:1。CE-LIF图谱显示，两条mRNA可清晰分离，分离度Rs为2.6；观测含量比例为49.9:50.1，与理论1:1高度一致。

图1. CD19 CAR mRNA与FLuc mRNA

在CE-LIF下可实现基线分离。

结果2：方法优化灵活，获得优峰形和分离度

方法优化结果显示，CD19 CAR mRNA在30 °C的毛细管温度下出现双峰或峰肩，可能与GC-rich序列引发的高阶结构有关。将毛细管温度提高至35 °C 后，CD19 CAR mRNA峰形改善为单一的清晰峰，并与FLuc mRNA保持良好分离。相比CE-UV，CE-LIF在峰形和分辨率方面表现更优。

图2. CE-LIF与CE-UV在不同毛细管温度下的分离条件优化对比

结果3：准确定量各价mRNA占比

研究进一步配制了多组CD19 CAR：FLuc mRNA的含量比例，包括20:1、8:1、2.5:1、1:1、0.4:1、0.2:1和 0.1:1。图谱峰面积比例与理论配制比例呈现一致的变化趋势；将实测与理论的比例进行线性拟合，R²达0.9979，说明该方法可用于双价mRNA-LNP中各价mRNA的可靠定量。

图3. CD19 CAR：与FLuc mRNA在不同配制比例下的峰面积变化

数据汇总

方法选择建议

综合峰形、定量比例和进样量的一致性，毛细管温度35 °C 、压力进样是模拟破乳条件下的**方案；对于低离子强度、低浓度样品，电动进样仍可作为提高灵敏度的可选策略。

应用价值

双价/多价mRNA疫苗	分辨相近长度mRNA，支持完整性和占比分析。
mRNA-LNP 工艺开发	破乳后快速评价不同长度mRNA的完整性、占比和一致性。
处方/稳定性研究	观察mRNA片段、大小变化及可能的降解趋势。
QC方法开发支持	建立可复制的CE-LIF平台方法，为复杂核酸药物质量研究提供数据基础。
平台拓展	从单价mRNA延伸至双价、多价mRNA-LNP组合分析。